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CRISPR快讯 第一期

CRISPR快讯 第一期

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  • 发布时间:2022-08-17
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【概要描述】CRISPR快讯Vol.1 生物强化西红柿为获取充足维生素D提供新途径-2022/5/23研究人员发现使用CRISPR-Cas9对西红柿进行基因编辑,可能是持续获取维生素D的新方法。通过CRISPR-Cas9基因编辑关闭西红柿基因组中特定基因Sl7-DR2来增加番茄果实和叶子中的维生素D3原的积累,而人皮肤暴露于紫外线下可以将维生素D3原转化为维生素D3。此方法可以应用于其他植物,如茄子、马铃薯和胡椒等,这为解决全世界将近10亿人缺乏维生素D这一巨大健康问题提供了可能。 来源:NaturePlantshttps://doi.org/10.1038/s41477-022-01154-6  DIPA-CRISPR,一种简单易操作的昆虫基因编辑方法-2022/5/23研究人员使用“直接亲本”CRISPR(DIPA-CRISPR)技术在蟑螂(德国小蠊)中进行基因编辑。实验表明将Cas9核糖核蛋白(RNP)注射到成年雌性蟑螂的血腔中,无需注射到胚胎,就可以有效地在发育中的卵母细胞中引入可遗传的突变。商业化的标准Cas9蛋白可以直接用于DIPA-CRISPR。DIPA-CRISPR的简单和可获取性将极大地扩展基因编辑技术应用到各种昆虫。 来源:CellReportsMethodshttps://doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100215  Cas9细胞外囊泡,一种新型基因编辑工具-2022/5/18研究人员开发出包含Cas9蛋白的细胞外囊泡(EV)作为一种新型基因编辑工具。在HEK293细胞中,每个EV可以加载大约25个Cas9蛋白分子,Cre报告基因和PCSK9基因的基因编辑效率分别为51%和6%。 来源:JournalofExtracellularVesicleshttps://doi.org/10.1002/jev2.12225 CRISPR/Cas13a辅助放大磁弛豫生物传感用于检测人血清中的miRNA-21-2022/5/29研究人员使用CRISPR-Cas13a信号放大系统来提高对人血清中特定miRNA检测的灵敏度。该系统采用磁弛豫开关(MRS)的方式直接检测样品中的miRNA,60分钟内检测限为0.22pM。CRISPR/Cas13a系统辅助MRS检测成功实现了复杂样本中miRNAs的准确、简单、快速检测,显示出在潜在的临床应用中检测miRNAs的巨大潜力。 来源:TrACTrendsinAnalyticalChemistryhttps://doi.org/10.1016/j.aca.2022.339853 使用新型SNP快速鉴定炭疽杆菌-2022/5/16炭疽杆菌是炭疽病的病原体,是一种致命的疾病和潜在的生物威胁。研究人员开发了一种重组酶聚合酶扩增(RPA)和Cas12a结合的快检方法,利用八个新型SNP位点对炭疽杆菌进行快速的即时现场鉴定。这种简单可靠的方法,利于当地医院和公共卫生项目快速检测炭疽杆菌。 来源:MicrobiologySpectrumhttps://doi.org/10.1128/spectrum.02285-21 比例荧光探针:基于CRISPR/cas12的生物传感平台的一种灵敏可靠的报告器-2022/5/3研究人员设计了一个比例荧光探针作为基于CRISPR/cas12的系统的报告器。实验选择荧光素(FAM)和四甲基罗丹明(TAMRA)作为两种荧光染料,分别标记5端和3端一个短的ssDNA,设计为一个比例荧光探针。当比例探针在480nm处激发时,借助FRET效应,探针发出580nm的TAMRA荧光。激活的Cas12a可以切割双标记的ssDNA,导致TAMRA的荧光降低,FAM的荧光增加。这种双响应荧光探针可以作为基于CRISPR/cas12的生物传感平台的报告器。与传统的TaqMan相比,以比例探针为报告器的CRISPR/cas12生物传感不仅具有更高的灵敏度,而且能够区分和避免假阳性信号。 来源:Analysthttps://doi.org/10.1039/D2AN00613H 通过CRISPR-Cas12a辅助级联扩增探测低丰度DNA甲基化-2022/5/3异常的DNA甲基化在肿瘤的发生和转移中起着重要的作用,被认为是一种有价值的非侵袭性癌症生物标志物。本文提出了一种易于操作的CRISPR-Cas系统辅助甲基化(CAM)方法,通过结合滚环(RCA)扩增和CRISPR-cas12a辅助级联扩增,对DNA甲基化进行灵敏检测。该方法具有高灵敏度,可以区分低至0.01%的甲基化水平,为加速基于甲基化癌症诊断和管理铺平了道路。 来源:Analysthttps://doi.org/10.1039/D2AN00170E

CRISPR快讯 第一期

【概要描述】CRISPR快讯Vol.1 生物强化西红柿为获取充足维生素D提供新途径-2022/5/23研究人员发现使用CRISPR-Cas9对西红柿进行基因编辑,可能是持续获取维生素D的新方法。通过CRISPR-Cas9基因编辑关闭西红柿基因组中特定基因Sl7-DR2来增加番茄果实和叶子中的维生素D3原的积累,而人皮肤暴露于紫外线下可以将维生素D3原转化为维生素D3。此方法可以应用于其他植物,如茄子、马铃薯和胡椒等,这为解决全世界将近10亿人缺乏维生素D这一巨大健康问题提供了可能。 来源:NaturePlantshttps://doi.org/10.1038/s41477-022-01154-6  DIPA-CRISPR,一种简单易操作的昆虫基因编辑方法-2022/5/23研究人员使用“直接亲本”CRISPR(DIPA-CRISPR)技术在蟑螂(德国小蠊)中进行基因编辑。实验表明将Cas9核糖核蛋白(RNP)注射到成年雌性蟑螂的血腔中,无需注射到胚胎,就可以有效地在发育中的卵母细胞中引入可遗传的突变。商业化的标准Cas9蛋白可以直接用于DIPA-CRISPR。DIPA-CRISPR的简单和可获取性将极大地扩展基因编辑技术应用到各种昆虫。 来源:CellReportsMethodshttps://doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100215  Cas9细胞外囊泡,一种新型基因编辑工具-2022/5/18研究人员开发出包含Cas9蛋白的细胞外囊泡(EV)作为一种新型基因编辑工具。在HEK293细胞中,每个EV可以加载大约25个Cas9蛋白分子,Cre报告基因和PCSK9基因的基因编辑效率分别为51%和6%。 来源:JournalofExtracellularVesicleshttps://doi.org/10.1002/jev2.12225 CRISPR/Cas13a辅助放大磁弛豫生物传感用于检测人血清中的miRNA-21-2022/5/29研究人员使用CRISPR-Cas13a信号放大系统来提高对人血清中特定miRNA检测的灵敏度。该系统采用磁弛豫开关(MRS)的方式直接检测样品中的miRNA,60分钟内检测限为0.22pM。CRISPR/Cas13a系统辅助MRS检测成功实现了复杂样本中miRNAs的准确、简单、快速检测,显示出在潜在的临床应用中检测miRNAs的巨大潜力。 来源:TrACTrendsinAnalyticalChemistryhttps://doi.org/10.1016/j.aca.2022.339853 使用新型SNP快速鉴定炭疽杆菌-2022/5/16炭疽杆菌是炭疽病的病原体,是一种致命的疾病和潜在的生物威胁。研究人员开发了一种重组酶聚合酶扩增(RPA)和Cas12a结合的快检方法,利用八个新型SNP位点对炭疽杆菌进行快速的即时现场鉴定。这种简单可靠的方法,利于当地医院和公共卫生项目快速检测炭疽杆菌。 来源:MicrobiologySpectrumhttps://doi.org/10.1128/spectrum.02285-21 比例荧光探针:基于CRISPR/cas12的生物传感平台的一种灵敏可靠的报告器-2022/5/3研究人员设计了一个比例荧光探针作为基于CRISPR/cas12的系统的报告器。实验选择荧光素(FAM)和四甲基罗丹明(TAMRA)作为两种荧光染料,分别标记5端和3端一个短的ssDNA,设计为一个比例荧光探针。当比例探针在480nm处激发时,借助FRET效应,探针发出580nm的TAMRA荧光。激活的Cas12a可以切割双标记的ssDNA,导致TAMRA的荧光降低,FAM的荧光增加。这种双响应荧光探针可以作为基于CRISPR/cas12的生物传感平台的报告器。与传统的TaqMan相比,以比例探针为报告器的CRISPR/cas12生物传感不仅具有更高的灵敏度,而且能够区分和避免假阳性信号。 来源:Analysthttps://doi.org/10.1039/D2AN00613H 通过CRISPR-Cas12a辅助级联扩增探测低丰度DNA甲基化-2022/5/3异常的DNA甲基化在肿瘤的发生和转移中起着重要的作用,被认为是一种有价值的非侵袭性癌症生物标志物。本文提出了一种易于操作的CRISPR-Cas系统辅助甲基化(CAM)方法,通过结合滚环(RCA)扩增和CRISPR-cas12a辅助级联扩增,对DNA甲基化进行灵敏检测。该方法具有高灵敏度,可以区分低至0.01%的甲基化水平,为加速基于甲基化癌症诊断和管理铺平了道路。 来源:Analysthttps://doi.org/10.1039/D2AN00170E

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CRISPR快讯 Vol.1

 

生物强化西红柿为获取充足维生素D提供新途径-2022/5/23

研究人员发现使用CRISPR-Cas9对西红柿进行基因编辑,可能是持续获取维生素 D 的新方法。通过CRISPR-Cas9基因编辑关闭西红柿基因组中特定基因Sl7-DR2来增加番茄果实和叶子中的维生素D3原的积累,而人皮肤暴露于紫外线下可以将维生素D3原转化为维生素 D3。此方法可以应用于其他植物,如茄子、马铃薯和胡椒等,这为解决全世界将近10亿人缺乏维生素D这一巨大健康问题提供了可能。

 

来源:Nature Plants

https://doi.org/10.1038/s41477-022-01154-6 

 

DIPA-CRISPR,一种简单易操作的昆虫基因编辑方法-2022/5/23

研究人员使用“直接亲本”CRISPR (DIPA-CRISPR) 技术在蟑螂(德国小蠊)中进行基因编辑。实验表明将Cas9 核糖核蛋白 (RNP) 注射到成年雌性蟑螂的血腔中,无需注射到胚胎,就可以有效地在发育中的卵母细胞中引入可遗传的突变。商业化的标准Cas9蛋白可以直接用于DIPA-CRISPR。DIPA-CRISPR的简单和可获取性将极大地扩展基因编辑技术应用到各种昆虫。

 

来源:Cell Reports Methods

https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100215 

 

Cas9细胞外囊泡,一种新型基因编辑工具-2022/5/18

研究人员开发出包含Cas9蛋白的细胞外囊泡(EV)作为一种新型基因编辑工具。在HEK293细胞中,每个EV可以加载大约25个Cas9蛋白分子,Cre报告基因和PCSK9基因的基因编辑效率分别为51%和6%。

 

来源:Journal of Extracellular Vesicles

https://doi.org/10.1002/jev2.12225

 

CRISPR/Cas13a辅助放大磁弛豫生物传感用于检测人血清中的miRNA-21-2022/5/29

研究人员使用CRISPR-Cas13a信号放大系统来提高对人血清中特定miRNA检测的灵敏度。该系统采用磁弛豫开关(MRS)的方式直接检测样品中的miRNA,60分钟内检测限为0.22pM。CRISPR/Cas13a系统辅助MRS检测成功实现了复杂样本中miRNAs的准确、简单、快速检测,显示出在潜在的临床应用中检测miRNAs的巨大潜力。

 

来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry

https://doi.org/10.1016/j.aca.2022.339853

 

使用新型SNP快速鉴定炭疽杆菌-2022/5/16

炭疽杆菌是炭疽病的病原体,是一种致命的疾病和潜在的生物威胁。研究人员开发了一种重组酶聚合酶扩增(RPA)和Cas12a结合的快检方法,利用八个新型SNP位点对炭疽杆菌进行快速的即时现场鉴定。这种简单可靠的方法,利于当地医院和公共卫生项目快速检测炭疽杆菌。

 

来源:Microbiology Spectrum

https://doi.org/10.1128/spectrum.02285-21

 

比例荧光探针:基于CRISPR/cas12的生物传感平台的一种灵敏可靠的报告器-2022/5/3

研究人员设计了一个比例荧光探针作为基于CRISPR/cas12的系统的报告器。实验选择荧光素(FAM)和四甲基罗丹明(TAMRA)作为两种荧光染料,分别标记5端和3端一个短的ssDNA,设计为一个比例荧光探针。当比例探针在480nm处激发时,借助FRET效应,探针发出580nm的TAMRA荧光。激活的Cas12a可以切割双标记的ssDNA,导致TAMRA的荧光降低,FAM的荧光增加。这种双响应荧光探针可以作为基于CRISPR/cas12的生物传感平台的报告器。与传统的TaqMan相比,以比例探针为报告器的CRISPR/cas12生物传感不仅具有更高的灵敏度,而且能够区分和避免假阳性信号。

 

来源:Analyst

https://doi.org/10.1039/D2AN00613H

 

通过CRISPR-Cas12a辅助级联扩增探测低丰度DNA甲基化-2022/5/3

异常的DNA甲基化在肿瘤的发生和转移中起着重要的作用,被认为是一种有价值的非侵袭性癌症生物标志物。本文提出了一种易于操作的CRISPR-Cas系统辅助甲基化(CAM)方法,通过结合滚环(RCA)扩增和CRISPR- cas12a辅助级联扩增,对DNA甲基化进行灵敏检测。该方法具有高灵敏度,可以区分低至0.01%的甲基化水平,为加速基于甲基化癌症诊断和管理铺平了道路。

 

来源:Analyst

https://doi.org/10.1039/D2AN00170E

 

 

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